在1916年7月6日，大总统黎元洪重新任命了各省的军政长官，标志着军阀割据的时代正式开始。在北洋派控制的省份，黎元洪基本上继续使用原来的军政长官；而在西南各省，他选择了护国军领袖和地方军阀来担任军政长官。这些人包括奉天督军兼省长张作霖、吉林督军孟恩远和省长郭宗熙、黑龙江督军兼省长毕桂芳、山东督军张怀芝和省长孙发绪、湖南督军赵倜和省长田文烈、山西督军阎锡山和省长沈铭昌、江苏督军冯国璋和省长齐耀琳、安徽督军张勋和省长倪嗣冲、江西督军李纯和省长戚扬、福建督军李厚基和省长胡瑞霖、浙江督军兼省长吕公望、湖北督军王占元和省长范守佑、四川督军兼省长蔡锷、陕西督军兼省长陈树藩、广东督军陆荣廷和省长朱庆澜、广西督军兼省长陈炳璇、云南督军唐继尧和省长任可澄、贵州督军刘显世和省长戴戡、直隶督军兼省长杨增新、甘肃督军兼省长张广建。这些军阀的出现导致全国形成了军阀割据的局面。
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