1993年3月6日，中国科学院计划进行综合配套改革，包括科研结构调整、人事、分配制度和机关管理、社会保障体系的改革。其中，中科院将继续重视和加强基础性研究，为基础性研究创造一个相对稳定和优越的环境。计划在5至10年内，将固定研究人员精干到现有科研人员的15％左右，同时加强流动客座的基础研究人员。对从事资源、环境、生态等基础性研究的队伍，也要保持在全院现有科研人员的15％左右。
此外，中科院还计划将经费支持逐步向长远性、基础性研究倾斜，转变机制，面向市场，以多种形式、多种层次进入社会主义市场经济领域，实现70％科技力量走上经济建设主战场。在应用研究与技术开发方面，逐步向企业管理方向过渡。
中科院新闻发言人表示，未来科学院的构成将包括全国学部委员组成的学部、从事基础研究和社会公益型研究的精干核心、一批已经转变机制、面向市场、经济自立、有自我发展能力的应用性研究所和工程中心，以及一批以股份联系的硅谷式小企业及有相当规模的综合性、外向型高技术企业集团。
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